Geheel naar de wens van prins Maurits is de kerk gebouwd in een achthoekige vorm (centraalbouw). De kerk is gebouwd zonder krans van kapellen en zijbeuken. Niet het altaar, maar de kansel moest het middelpunt vormen. De kerk staat model voor vele latere protestante kerken.
In de loop der jaren is de Koepelkerk herbouwd en gerestaureerd. Tijdens de openstelling kunnen bezoekers aan de hand van panelen en teksten leren over de geschiedenis van de kerk en de toren beklimmen. Ook de aanwezige gastvrouwen- en heren vertellen je graag over de kerk. In de toren organiseert de Stichting Vrienden van de Koepelkerk met regelmaat exposities die tijdens een bezoek aan de Koepelkerk te bekijken zijn. De locatie is toegankelijk voor rolstoel- of scootmobielgebruikers.
